Botanik - Molekulare Zellbiologie


Botanisches Institut              Plant Cell Biology - Methods and Concepts.........        ..
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AG Nick

Richtiges Protokollieren

Worauf kommt es an? Welchen Sinn haben diese Regeln?

Klausur, Fr 30.3. HS Neue Chemie
8:00-10:00

Zum Reinschauen: Das Neueste für Studierende gut erklärt: Plant Cell Biology of the Mathur lab The Illuminated Plant Cell


Projects March 2012


Anmerkungen: abhängig vom Hintergrund sind die Projekte geeignet für

 

Chemische Biologie: 3.3, 4.1, 4.2, 4.3, 5, 6

Bachelor Biologie: 3.1, 3.2, 3.3, 4.1, 4.2, 4.3

Master Biologie: 3.1, 3.2, 5, 6

 

Aus didaktischen Gründen müssen gemischte 2-er Teams (nur für 5 3-er Team) gebildet werden. Also: 1 x Chemische Biologie + 1 Bachelor Biologie geht, 1 x Bachelor Biologie + 1 x Master Biologie geht, aber 2 x Bachelor Biologie geht nicht

 

Cytoskeleton and Development

 

Project 3 Wie sich anarchische Pflanzenzellen selber organisieren

 

3.1 manipulate the actin-auxin oscillator by inducible knock-down of actin-depolymerisation factor 2 (2 people, Dr. J. Maisch)

3.2 microfluidics, cell polarity and auxin flow (2 people, Dr. J. Maisch)

3.3 pattern formation and uptake of cell permeable peptides (2 people, Dr. J. Maisch & Dr. K. Eggenberger)

 

Nanobiology with Plant Cells

 

Project 4 Trojanische Pferde für Chemical Engineering

 

Subprojects on cell permeable peptides

 

4.1 role of the cytoskeleton for uptake of CPPs (2 people, Dr. K. Eggenberger)

4.2 structure-function relations of uptake using a series of stereoisomeric derivatives of the CPP TP10 (2 people, Dr. K. Eggenberger)

4.3 uptake and toxicology of PKA and SV40 (2 people, Dr. K. Eggenberger)

 

Project 5: Superresolution microscopy

 

Projekt: Touring through super-resolution microscopy (3 people, AG Nienhaus, Physics)

 

Protein-protein interaction by FRET,
FLIM-FRET and PALM microscopy
in high resolution (20 nm resolution).

 

Project 6: Plant Bioelectrics

 

Projekt: Electrophysiology of plant membranes (2 people, AG Wegner,CN-IHM)

 

 

Glossar der Begriffe


Lernziele


  • Vertiefte Einführung in die Methoden und Konzepte der modernen pflanzlichen Zellbiologie.

  • Kompetenz in der Interpretation der gängigen Labormethoden.

  • Gründliches Verständnis dieser Methoden.

  • Heranführung an eigenständiges wissenschaftliches Denken, kritischer Umgang mit Primär- und Sekundärliteratur.

  • Zelluläre Aspekte der pflanzlichen Entwicklung.


Ablauf und Spielregeln des Moduls


Blockperiode vor Beginn des Wintersemesters und Blockperiode nach Ende des Wintersemesters

Das Modul kann wahlweise als F2 (dann muß man die Klausur mitschreiben) oder F3 (dann muß man die Klausur nicht mitschreiben) belegt werden.

Theoretischer Teil (2 SWS) – erste Woche des Blocks

Aufbau: vormittags Vorlesung, nachmittags Gruppenarbeit zu Inhalten von Vorlesung und künftigen Projekten.

Vorlesung Methoden und Konzepte der Zellbiologie

HS Botanisches Institut 1

Datum Zeit Thema Folien Übungsblätter und Material
         
Mo, 20.02.2012 09:30-11:00 Detection 1: Fluorescence Microscopy and Image Analysis pdf hier
Di, 21.02.2012 09:30-11:00 Detection 2: Fluorescent Proteins and Probes pdf hier
Mi, 22.02.2012 09:30-11:00 Manipulation: Micromethods and Molecular Techniques pdf hier
Do, 23.02.2012 09:30-11:00 Concepts 1: Plant Cytoskeleton - Current Topics pdf hier
Fr, 24.09.2012 09:30-11:00 Concepts 2: Plant Development - Cellular Base pdf hier

Gruppenarbeit

Zu den Vorlesungen gibt es Aufgabenblätter, die am Nachmittag in Gruppen bearbeitet werden. Um diese zu lösen, muß man auf weitere Resourcen (Internet, Originalarbeiten) zurückgreifen. Diese Aufgabenblätter werden am Ende der ersten Versuchswoche abgegeben (insgesamt also 5 Aufgabenblätter). Je Aufgabenblatt können 1 Bonuspunkt erworben werden, für sehr exzellente Bearbeitungen noch 1 Bonuspunkt insgesamt, maximal also 6 Bonuspunkte.

Parallel dazu muss jede Gruppe zu der von ihr bearbeiteten Thematik einen Projektantrag konzipieren, wie er im Rahmen einer Bachelorarbeit im Zeitraum von etwa 3 Monaten bearbeitet werden könnte. Rahmenbedingungen: Umfang maximal 5 Seiten. Abgabe bis Ende des darauffolgenden Blocks

 

Aufbau:

 

Titelseite: Titel des Projekts, Namen und Kontaktadressen der Team-Mitglieder

Teil 1 (etwa 1 Seite): Stand der Forschung, was weiss man schon über die Thematik, was ist noch unklar (Aussagen müssen über Literaturzitate belegt werden.

Teil 2 (etwa 1 Seite): konkrete Fragestellung, Vorarbeiten, Techniken und Werkzeuge, die zur Verfügung stehen (sollten).

Teil 3 (etwa 2 Seiten): Arbeitsprogramm (Beschreibung der Teilschritte und deren Dauer, wie sind die zeitlich angeordnet).

Teil 4 (etwa 1 Seite): Abschätzung der Kosten (Personalkosten, Sachmittel, Geräte) und Voraussetzungen (welche Geräte und Infrastruktur steht zur Verfügung.

Anhang (etwa 1-2 Seiten): Quellenangaben, kurze Lebensläufe der Antragssteller

 

Wozu das? Nicht nur in der Forschung, auch im Wirtschaftsleben muss man für die Ideen und Projekte, die man hat, um Mittel werben / kämpfen. Dazu muss man sich vor allem über das, was man will im Klaren sein und muss das auch klar anderen erklären können. Gleichzeitig dient der Projektantrag der inhaltlichen Vorbereitung des sich ab Woche 2 anschliessenden Forschungsprojekts. Die Gruppe kann sich hier 6 Bonuspunkte (5 % der Gesamtpunktzahl) erwerben. Zur Vorbereitung des Projektantrags gibt es an den ersten beiden Nachmittagen der ersten Woche jeweils eine Anfangsbesprechung, um die Grundideen zu entwickeln. 

Klausur

Die Klausur zu dem Modul findet am Ende der Blockperiode statt. und dauert 2 Stunden. Die Bonuspunkte (maximal 6 für die Übungsblätter, 6 für den Projektantrag, 6 für das Protokoll und 6 für den Vortrag = 24) gehen in das Klausurergebnis mit ein. Bei der Klausur sind keine Hilfsmittel zugelassen.

Praktischer Teil (Bachelor 10 SWS/Master 6 SWS)

2-3 Wochen ein Projekt aus laufenden Forschungsarbeiten. Gruppe sollte möglichst eigenständig arbeiten.

Ablauf:

  • Einführungsbesprechung

  • Methodische Einweisung

  • Kurze Lagebesprechungen während des Projekts

  • Abschlussbesprechung am Ende des Projekts

  • Präsentation des Projekts im Rahmen des Institutskolloquiums

Es müssen zu allen Versuchen Gruppenprotokolle abgeliefert werden. Auf korrekte Protokollierung wird großen Wert gelegt. Gute Protokolle können mit bis zu 6 Bonuspunkten (5 % der Gesamtpunktzahl) bewertet werden. Zeitpunkt: bis Ende des darauffolgende Blocks

Für den Vortrag kann die Gruppe weitere 6 Bonuspunkte (weitere 5 % der Gesamtpunktzahl) erwerben.


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